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Consortium HOLOAE (2023 - 2024)

HOLOAE - Réseau HOlObiontes des Animaux d’Elevage

Dans le cadre de leurs nouveaux schémas stratégiques, les directions des départements MICA-GA-PHASE-SA se sont engagées à unir leurs forces sur la thématique "Holobiontes-animaux d’élevage". Une meilleure connaissance des interactions au sein des holobiontes, entre les hôtes animaux et leurs microbiotes est nécessaire pour relever le défi de la durabilité des productions des animaux d’élevage et des questions de santé dans le concept "One Health – une seule santé".

Le réseau sera porté par 2 coordinateurs, soutenu par un comité de pilotage formé de 7 personnes et impliquera de nombreuses équipes INRAE de compétences différentes.

Objectifs

Le consortium aura pour but de :

  1. fédérer et structurer la communauté INRAE travaillant sur les holobiontes animaux d’élevage,
  2. positionner INRAE à l’échelle internationale sur des fronts de sciences et pour cela de favoriser la construction de projets de recherche communs et de publier des revues sur ces sujets.

Ce réseau est centré sur les microbiotes (intestinaux et autres) des animaux d’élevage, qu’ils soient ruminants ou monogastriques. Même si les études sur l’homme ne sont pas directement incluses, des discussions seront menées avec les équipes travaillant sur ce thème en termes d’approche.

L’objectif d’approfondir les connaissances sur les holobiontes des animaux d’élevage afin de mieux comprendre les interactions mutuelles entre Hôte-microbiotes-pathogènes est le cœur de l’axe 1 du métaprogramme Holoflux. Ces connaissances permettront de trouver des leviers d’action pour prédire et piloter les phénotypes ou les susceptibilités liés à la santé animale et l’efficience productive et environnementale des animaux ; cette partie est intégrée dans l’axe 3 du métaprogramme.

Ce réseau a l’ambition de fédérer une communauté scientifique qui est actuellement cloisonnée (par espèce, par organe, par approche méthodologique).

Contact - Coordination :

Acteurs du projet

Partenaires INRAE

DépartementsUnitésExpertises
SAEPIADynamiques des communautés microbiennes et gestion de la santé animale
GAGABIRôle de l’interaction entre génétique et microbiote intestinal dans la santé chez la poule et le porc
PHASE, GAGenPhySERôle du microbiote et de ses métabolites dans le développement de l’intestin chez le porc et le lapin ; déterminisme génétique du microbiote ruminal des ovins
PHASEHerbivoresMicrobiote gastro-intestinal des ruminants ; relation avec des phénotypes d’intérêt (émission de méthane, efficience alimentaire)
MICAISPRôle du microbiote intestinal dans l’infection des monogastriques par Salmonella
MICASTLOMicrobiote et santé mammaire bovine
PHASEUMRHMicrobiote digestif des ruminants et son rôle dans les performances et la santé animale
SAVIMInteraction du microbiote pulmonaire et de l’immunité du jeune pour la santé respiratoire