Thèse Tiffany GARIN (2020 - 2023)

Impact des compétitions intermicrobiennes via les systèmes de sécrétion de type VI (T6SS) sur la dynamique du microbiote des graines

Pour exploiter les associations bénéfiques graines-microbiotes en agriculture, il est nécessaire de comprendre comment s’assemblent ces microbiotes et quelles sont leurs dynamiques pendant les étapes précoces de développement de la plante. L’habitat offert par les graines est assez réduit en espace et en ressources ce qui induit une sélection et un fort goulot d’étranglement des populations microbiennes.

En conséquence, la diversité du microbiote de la graine est plutôt limitée et avec peu de taxons dominants en comparaison des autres habitats de la plante. Néanmoins une diversité importante est maintenue dans les assemblages microbiens des graines. La composition et les fonctions des assemblages sont en partie expliquées par des capacités métaboliques microbiennes diversifiées. Les compositions des microbiotes peuvent être aussi régulées par des interactions intermicrobiennes au moyen d’armes antimicrobiennes spécifiques. Certains phyla bactériens dominants des graines possèdent de telles armes comme les systèmes de sécrétion de type VI (ou T6SS) ciblant d’autres microorganismes avec des effecteurs antimicrobiens. A ce jour la contribution de tels systèmes de sécrétion dans l’assemblage du microbiote des graines et implicitement dans les performances des graines n’est pas connue. Le projet vise à explorer le rôle de T6SS bactériens dans la dynamique d’assemblage de microbiotes de graine de brassicacées et leur impact directs ou indirects sur la transmission d’agents pathogène par la graine.

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Financement :

  • 50% INRAE
  • 50% Région Pays-de-la-Loire

Voir aussi

Publication

Tiffany Garin (2024) Impact des compétitions inter-microbiennes médiées par le Système de Sécrétion de Type VI (T6SS) sur la dynamique de transmission du microbiote des graines aux plantules
 Thèse de doctorat, Université d'Angers. →  https://theses.fr/2024ANGE0008

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