Impact des compétitions intermicrobiennes via les systèmes de sécrétion de type VI (T6SS) sur la dynamique du microbiote des graines

En conséquence, la diversité du microbiote de la graine est plutôt limitée et avec peu de taxons dominants en comparaison des autres habitats de la plante. Néanmoins une diversité importante est maintenue dans les assemblages microbiens des graines. La composition et les fonctions des assemblages sont en partie expliquées par des capacités métaboliques microbiennes diversifiées. Les compositions des microbiotes peuvent être aussi régulées par des interactions intermicrobiennes au moyen d’armes antimicrobiennes spécifiques. Certains phyla bactériens dominants des graines possèdent de telles armes comme les systèmes de sécrétion de type VI (ou T6SS) ciblant d’autres microorganismes avec des effecteurs antimicrobiens. A ce jour la contribution de tels systèmes de sécrétion dans l’assemblage du microbiote des graines et implicitement dans les performances des graines n’est pas connue. Le projet vise à explorer le rôle de T6SS bactériens dans la dynamique d’assemblage de microbiotes de graine de brassicacées et leur impact directs ou indirects sur la transmission d’agents pathogène par la graine.